Seiring dengan perkembangannya, Program studi D3 Farmasi yang telah eksis memiliki 5 Laboratorium di bawah UPT Laboratorium STIKES. Kelima laboratorium tersebut adalah Laboratorium Teknologi Farmasi, Laboratorium Kimia Farmasi, Laboratorium Biologi Farmasi, Laboratorium Komunitas dan Pelayanan, serta Laboratorium Farmakognosi.